De film begint met Sonic die wegloopt van Dr. Robotnik. De film spoelt dan terug naar het begin.
Sonic loopt in Green Hill Zone en brengt een bloem terug naar Longclaw, Sonic's beschermer. Longclaw waarschuwt Sonic dat iemand hem gezien kan hebben, maar Sonic gelooft haar niet. Het blijkt dat ze gelijk heeft en dat meerdere mensen hem hebben gezien, en hen aanvallen vanwege zijn snelheid. Longclaw geeft Sonic haar ringen, en vertelt hem dat ze tussen dimensies kunnen reizen, en dat Sonic ze moet gebruiken als hij ooit gezien wordt. Sonic gebruikt de ring en gaat naar een andere dimensie. Hij probeert terug te keren naar zijn thuiswereld, maar de poort sluit zich voordat hij dat kon doen.
Tien jaar later zou Sonic uiteindelijk zijn weg naar de Aarde vinden. Daar verveelt Tom Wackowski, die parkeerwacht heeft, zich en wacht op een auto die snelheid maakt. Hij vindt een schildpad en zijn snelheidspistool geeft "0,01" aan. Dan passeert Sonic en zijn snelheidspistool geeft 296 aan. Hij passeert opnieuw, deze keer geeft zijn pistool 300 aan. De schildpad staat op straat, op het punt te worden overreden, wanneer Sonoc hem redt, en hem naar een bos brengt, en terugkeert naar huis.
Sonic vertelt de kijkers zijn leven, en laat dan per ongeluk zijn ringen vallen. Hij raapt ze op, en vertelt dan dat als hij wordt opgemerkt, hij naar een paddenstoelenplaneet zal moeten migreren.
Nadat hij die avond naar een honkbalwedstrijd heeft gekeken, speelt hij in zijn eentje honkbal, maar beseft dat hij alleen is en rent hard weg, waarbij hij per ongeluk een stroomstoring veroorzaakt aan de hele Pacifische kust. De regering stelt Dr. Robotnik voor om dit uit te zoeken.
Dr. Robotnik voegt zich bij het onderzoek en beledigt de arbeiders. Hij gebruikt zijn technologie en een van zijn drones vindt een blauwe haar van Sonic. Robotnik identificeert dit als een "nieuwe soort".