De huidige Zhejiang Universiteit werd officieel opgericht in 1998, maar de belangrijkste wortel ervan, Qiushi Academie, gaat terug tot 1897 in de Qing-dynastie. In die tijd was de Qiushi Academie een van de eerste moderne academies voor hoger onderwijs in China. Tussen 1901 en 1927 werd de naam van de Qiushi Academie vele malen veranderd: Zhejiang Academy, Zhejiang Advanced College, Yuying Academy, enz. In 1928 werd ze officieel de Nationale Zhejiang Universiteit genoemd. Na het uitbreken van de Verzetsoorlog tegen Japan in 1937 begon de Zhejiang Universiteit zich te verplaatsen naar het westen van China, wat de "Lange Mars van de Cultuur" werd genoemd. Onder leiding van Chu Kochen werd de Zhejiang Universiteit een van de toonaangevende universiteiten in China en bereikte een reeks prestaties op het gebied van onderwijs en onderzoek. En in 1944 werd zij geëerd als "Oriëntaals Cambridge" door Joseph Needham, de beroemde Britse geleerde die de Zhejiang Universiteit tweemaal bezocht. Toen het verzet tegen Japan ten einde liep, verhuisde de Zhejiang Universiteit in 1946 terug naar Hangzhou en in 1951 werd het al een uitgebreide universiteit. In 1952, als gevolg van de nationale vernieuwing van het onderwijssysteem, werd de Zhejiang Universiteit geherstructureerd en opgesplitst in 15 instellingen. Totdat de vier universiteiten met hetzelfde semester in 1998 fuseerden tot de nieuwe Zhejiang Universiteit, concentreerden Zhejiang Universiteit, Hangzhou Universiteit, Zhejiang Landbouw Universiteit, Zhejiang Medische Universiteit zich op onderzoek en onderwijs op hun eigen gebied en leidden zij een groot aantal uitstekende professionals op. En uiteindelijk werd op 15 september 1998 de nieuwe Zhejiang Universiteit gevormd, die zich in de afgelopen 12 jaar snel ontwikkelde en alles in het werk stelde om zich te ontwikkelen tot een van de eersteklas universiteiten in de wereld.