Notts County is opgericht in 1862. De club werd opgericht vóór de Football Association en in het begin speelden zij een spel met clubregels, in plaats van verenigingsvoetbal. Bij de oprichting werd Notts County, zoals de meeste sportteams, beschouwd als een "gentlemen-only" club. Notts County wordt beschouwd als een van de pioniers van het huidige spel en wordt zelfs gecrediteerd voor de uitvinding van de buitenspelval[]. Notts County is de oudste van de professionele voetbalclubs in de wereld (er zijn oudere professionele clubs in andere voetbaltakken).
In het begin speelde de club in Park Hollow bij Nottingham Castle. In december 1864 werd besloten wedstrijden te gaan spelen tegen teams van buitenaf, en werd besloten dat de club een grotere locatie moest vinden. Na op verschillende plaatsen gespeeld te hebben, vestigden The Magpies zich in 1883 op Trent Bridge Cricket Ground.
Football League
In 1888 werd Notts County, samen met elf andere voetbalclubs, stichtend lid van The Football League. Ze eindigden hun eerste competitieseizoen op de elfde plaats. Notts County eindigde in 1890-91 als derde in de competitie en ook tien seizoenen later eindigden ze als derde.
FA Cup finales
Op 25 maart 1891 bereikte Notts County voor het eerst de finale van de FA Cup, maar won niet.
Notts County maakte dit goed in 1894, toen ze voor het eerst in hun geschiedenis de FA Cup wonnen op Goodison Park. De Magpies versloegen Bolton Wanderers met 4-1 en Jimmy Logan scoorde de eerste hattrick in de geschiedenis van de FA Cup-finale. Notts County werd de eerste club buiten de hoogste divisie die de FA Cup won - ze eindigden dat seizoen op de derde plaats in de Second Division.