Van 1826 tot 1840 leidde Knox Barclay's anatomische school in Surgeon's Square, Edinburgh. Hij was de populairste docent anatomie in Schotland, maar zijn klas had altijd te weinig lichamen om te ontleden.
Voordat de Anatomy Act van 1832 het aanbod verruimde, waren de enige legale aanvoer van lijken voor anatomische doeleinden in het Verenigd Koninkrijk die welke ter dood veroordeeld waren en door de rechtbanken werden ontleed. Dit leidde tot een tekort aan legitieme onderwerpen voor dissectie. Dit tekort werd nog nijpender toen de behoefte om medische studenten op te leiden toenam en het aantal executies afnam.
Op zijn school stuitte Knox van meet af aan op het probleem, aangezien de Royal Colleges na 1815 de studie van de anatomie in het medisch curriculum hadden uitgebreid. Als hij les zou geven volgens de zogenaamde "Franse methode" zou de verhouding één lijk per leerling moeten benaderen. Als gevolg daarvan werd het stelen van lijken zo gewoon dat het niet ongebruikelijk was dat familieleden en vrienden van iemand die net was overleden, voor en na de begrafenis op het lichaam pasten om te voorkomen dat het werd meegenomen.
In november 1827 begon William Hare aan een nieuwe carrière toen een huurder met een schuld bij hem toevallig overleed. Hij kreeg £7.10/- (zeven pond en tien shilling) betaald voor het afleveren van het lichaam bij Knox. Burke en zijn handlanger Hare begonnen nu regelmatig zwervers en dronkaards te vermoorden. Na nog 16 transacties, in wat bekend werd als de West Port Murders, werden Burke en Hare op 2 november 1828 gepakt. De hele stad werd met afgrijzen vervuld, gevoed door balladen, pamfletten en kranten, over de vreselijke daden van Burke & Hare. Hare draaide King's bewijs om, en Burke werd opgehangen, ontleed en tentoongesteld.
Burke is de slager, Hare is de dief,
Knox, de jongen die het vlees koopt!
Knox werd niet vervolgd, wat velen in Edinburgh verontwaardigde. Zijn huis werd aangevallen door een menigte, en ruiten werden ingegooid. Een commissie van de Royal Society of Edinburgh sprak hem vrij van blaam, maar men kon zijn aandeel in de zaak niet vergeten, en velen waren op hun hoede voor hem.