Carsonella ruddii
Candidatus Carsonella ruddii is een endosymbiotische gamma-proteobacterie. Het heeft het kleinste bekende genoom van alle bacteriën.
De soort is een endosymbiont die aanwezig is in alle soorten floemsap-voedende insecten, bekend als psylliden. De endosymbiont komt voor in een gespecialiseerde structuur die bekend staat als het bacteriome.
In 2006 werd het genoom van één stam van Ca. C. ruddi gesequeneerd bij RIKEN in Japan en de Universiteit van Arizona. Het genoom is een cirkelvormig chromosoom van 159.662 basenparen en heeft een hoge coderingsdichtheid (97%) met veel overlappende genen en een beperkte genlengte. Het aantal voorspelde genen bedroeg 182, ook het laagste ooit gemeten (NCBI-Genome). Talrijke genen die als essentieel voor het leven worden beschouwd, lijken te ontbreken, wat suggereert dat de soort wellicht de status van organel heeft bereikt.
Ter vergelijking: Mycoplasma genitalium, dat het kleinste genoom heeft van alle vrij levende organismen, heeft een genoom van 521 genen.
Vragen en antwoorden
V: Wat is Candidatus Carsonella ruddii?
A: Candidatus Carsonella ruddii is een endosymbiotische gamma-proteobacterie die aanwezig is in alle soorten phloemsap etende insecten die bekend staan als psylliden.
V: Hoe groot is het genoom van Candidatus Carsonella ruddii?
A: Het genoom van Candidatus Carsonella ruddii is het kleinste bekende genoom van een bacterie en bestaat uit een cirkelvormig chromosoom van 159.662 basenparen.
V: Hoeveel genen worden voorspeld in Candidatus Carsonella ruddii?
A: Het aantal voorspelde genen in Candidatus Carsonella ruddii is 182, het laagste aantal ooit gemeten (NCBI-Genome).
V: Wat is de coderingsdichtheid van het genoom van Candidatus Carsonella ruddii?
A: Het genoom van Candidatus Carsonella ruddii heeft een hoge coderingsdichtheid van 97%.
V: Wat is het bacterioom?
A: Het bacterioom is een gespecialiseerde structuur waar de endosymbionten voorkomen in Candidatus Carsonella ruddii.
V: Wat ontbreekt er in het genoom van Candidatus Carsonella ruddii?
A: In het genoom van Candidatus Carsonella ruddii lijken talrijke genen te ontbreken die als essentieel voor het leven worden beschouwd, wat erop wijst dat de soort de status van organel heeft bereikt.
V: Hoe verhoudt het genoom van Candidatus Carsonella ruddii zich tot dat van Mycoplasma genitalium?
A: Het genoom van Mycoplasma genitalium, dat het kleinste genoom heeft van alle vrijlevende organismen, heeft 521 genen, wat aanzienlijk meer is dan het aantal voorspelde genen in Candidatus Carsonella ruddii.