Genoom
Het genoom van een organisme is het geheel van zijn erfelijke informatie die gecodeerd is in zijn DNA (of, voor sommige virussen, RNA). Dit omvat zowel de genen als de niet-coderende sequenties van het DNA. Professor Hans Winkler bedacht de term in 1920.
Winkler's definitie, in vertaling, loopt:
"Ik stel de expressiegenoom voor de haploïde chromosomenreeks voor, die samen met het relevante protoplasma de materiële fundamenten van de soort specificeert ...." p165
Echter, geen enkele haploïde chromosoomset definieert zelfs het DNA van een soort. Door de enorme verscheidenheid aan allelen die door een populatie worden gedragen, is elk individu genetisch verschillend. Zelfs een diploïde individu draagt een genetische verscheidenheid. Om die reden gaf Dobzhansky de voorkeur aan "set van chromosomen", en de definitie moet nu breder zijn dan de definitie van Winklers. Het genoom van een haploïde chromosoomset is slechts een staaltje van de totale genetische variatie van een soort.
De term 'genoom' kan specifiek worden gebruikt om de volledige set van nucleair DNA (het 'nucleair genoom') aan te duiden, maar kan ook worden gebruikt voor organellen die hun eigen DNA bevatten, zoals bij het mitochondriaal genoom of het chloroplastgenoom.
Genoomafmetingen
| Organisme | Genoomgrootte (basenparen) | Noot: |
| Virus, Bacteriophage MS2 | 3569 | Eerste opeenvolgende RNA-genoom |
| Virus, SV40 | 5224 | |
| Virus, Phage Φ-X174 | 5386 | Eerste gesequenteerde DNA-genoom |
| Virus, Faag λ | 5×104 | |
| 1.6×105 | Kleinste niet-virale genoom, februari 2007 | |
| Bacterie, Escherichia coli | 4×106 | Best onderzochte bacterie. |
| Bacterie, Solibactoer usitatus | 1×107 | Grootste bekende bacterieel genoom |
| Protisten, Amoebe dubia | 6.7×1011 | Grootste bekende genoom, maar omstreden. |
| Plant, Arabidopsis thaliana | 1.57×108 | Eerste plantengenoom gesequenced, Dec 2000. |
| Plant, Genlisea margaretae | 6.34×107 | Kleinste geregistreerde bloeiende plantengenoom, 2006. |
| Plant, Fritillaria assyrica | 1.3×1011 | |
| Plant, Populus trichocarpa | 4.8×108 | Eerste boomgenoom, september 2006 |
| Gist, Saccharomyces cerevisiae | 2×107 | |
| Schimmel, Aspergillus nidulans | 3×107 | |
| Nematode, Caenorhabditis elegans | 9.8×107 | Eerste multicellulair dierlijk genoom, december 1998. |
| Insecten, Drosophila melanogaster oftewel fruitvlieg... | 1.3×108 | |
| Insecten, Bombyx mori aka zijdevlinder | 5.30×108 | |
| Insecten, Apis mellifera aka honingbij | 1.77×109 | |
| Vis, Tetraodon nigroviridis, type kogelvis | 3.85×108 | Kleinste gewervelde genoom bekend |
| 3×109 | ||
| Vis, Protopterus aethiopicus aka gemarmerde longvis | 1.3×1011 | Grootste gewervelde genoom bekend |
Opmerking: Het DNA van een enkele menselijke cel heeft een lengte van ~1,8 m (maar bij een breedte van ~2,4 nanometer).
Gerelateerde pagina's
- Gene
- Volgordeanalyse
- Menselijk genoom
- ENCODE: de volledige analyse van het menselijk genoom
Vragen en antwoorden
V: Wat is een genoom?
A: Een genoom is het geheel van de erfelijke informatie van een organisme, gecodeerd in zijn DNA (of, voor sommige virussen, RNA). Dit omvat zowel de genen als de niet-coderende sequenties van het DNA.
V: Wie heeft de term "genoom" bedacht?
A: Professor Hans Winkler bedacht de term "genoom" in 1920.
V: Wat definieerde Winkler als een genoom?
A: Winkler definieerde een genoom als "de haploïde chromosomenreeks, die samen met het relevante protoplasma de materiële grondslagen van de soort bepaalt".
V: Heeft elk individu genetische verscheidenheid?
A: Ja, door de allelen die een populatie draagt, is elk individu genetisch verschillend. Zelfs diploïde individuen dragen genetische variëteit.
V: Wat betekent het als wij zeggen "nucleair genoom"?
A: Als we het hebben over "nucleair genoom", bedoelen we specifiek de volledige set nucleair DNA.
V: Zijn er naast nucleaire genomen nog andere genomen?
A: Ja, er zijn ook mitochondriale genomen en chloroplastische genomen die hun eigen DNA bevatten.
