Djibouti nam deel aan de Olympische Zomerspelen van 2000 in Sydney, Australië, die van 15 september tot 1 oktober werden gehouden. Dit was de vijfde keer dat Dijibouti naar de olympische spelen ging sinds de eerste keer in 1984 in Los Angeles. Dijibouti stuurde twee atleten naar de Olympische Spelen in 2000, beide namen deel aan atletiekwedstrijden. De twee atleten waren Omar Daher Gadid die meedeed aan de marathon voor mannen en Roda Ali Wais die meedeed aan de 800 meter voor vrouwen. Gadid finishte de marathon niet en Ali Wais kwam niet door de eerste ronde van haar onderdeel.