In het begin van het boek is Maxwell "Max" Kane een jongen met een laag gevoel van eigenwaarde, net als zijn vader; ze zijn allebei "traag". Hij woont bij zijn grootouders Grim en Gram. Max vindt zichzelf dom en hij zit in een gehandicaptenklas. Mensen zijn bang voor hem omdat hij lijkt op zijn vader, "Killer Kane," een veroordeelde moordenaar. Max zet de toon voor het verhaal door herinneringen op te halen aan zijn tijd op de crèche, toen hij bekend stond als Kicker en Kevin, het andere hoofdpersonage, bekend stond als Freak. Kevin was altijd anders omdat hij klein was en krukken en beenbeugels nodig had om te kunnen lopen. Maar Max respecteerde hem toen al vanwege zijn dodelijke blik en vond de krukken en beenbeugels cool. Vele jaren later, als Max op de middelbare school zit, begint het echte verhaal.
Max ontdekt dat er mensen in het huis naast hem gaan wonen. De nieuwe buren blijken Freak en zijn moeder Gwen te zijn, die Freak "De Schone Gwen" noemt, naar de vrouw van Koning Arthur. De jongens sluiten vriendschap. Ze gaan samen naar het vuurwerk van Fourth of July, en zet Freak op zijn schouders zodat hij kan zien. De lokale stoere jongen, Tony D. "Blade", achtervolgt de twee met zijn bende omdat Freak hem een idioot noemde. Met Max' grootte en snelheid en Freak's aanwijzingen en meesterplan om de vijver in te rennen, houden ze zich veilig totdat ze gered worden door de politie. Na dit incident begint Freak op de schouders van Max te rijden. Ze noemen hun gecombineerde vorm "Freak de Machtige". De vriendschap is goed voor hen beiden; ze komen voor elkaar op en Kevin leert Max zelfs om goed te lezen en te leren. Ze beleven avonturen zoals naar het ziekenhuis gaan waarvan Freak beweert dat het een geheime afdeling heeft genaamd de "Bionics Department" die zijn hersenkat heeft laten scannen om in een kunstlichaam te laten zetten. Op een avontuur vinden ze de handtas van een vrouw in het riool. Ze brengen het terug naar de vrouw die Loretta Lee heet. Loretta is de vrouw van Iggy Lee, baas van de Panheads, een motorbende die "iedereen angst inboezemde, zelfs de politie", zoals Max het zegt. Ze hield ervan om rare dingen te eten, zoals koeienvlaai en een heleboel walgelijke dingen, want zo was haar bende. Iggy zegt dat de twee ooit de vader van Max hebben gekend. Ze willen "wat plezier maken" met de jongens maar bedenken zich omdat ze bang zijn dat Max' vader boos zal worden. Ze zijn bang voor Max' vader, ook al zit hij een levenslange gevangenisstraf uit. Ze onthullen ook dat Kevin's vader vertrok toen hij hoorde dat zijn zoon een geboorteafwijking had.
Op school, sterft Freak bijna wanneer hij stikt na het eten van Amerikaanse chop suey. Max waarschuwt de verpleegster. Freak wordt naar het ziekenhuis gebracht. Later onthult Grim aan Max dat zijn vader voorwaardelijk is vrijgelaten. In de loop van het verhaal wordt langzaam duidelijk dat Max' vader zijn moeder heeft vermoord door haar te wurgen, en dat Grim en Gram hem haten en bang zijn dat Max net zo zal eindigen als hij. Max is geschokt en bang door het nieuws van zijn vaders voorwaardelijke vrijlating. Freak keert terug uit het ziekenhuis en de twee vieren samen kerstavond. Na kerstavond wordt Max gewekt door zijn vader, Killer Kane, die hem is komen ontvoeren. Nadat Max door zijn vader is ontvoerd, rijden de twee naar het appartement van Iggy Lee in de "New Testaments" (eigenlijk huurkazernes). Killer Kane is nog groter dan Max en gedraagt zich zeer dreigend en intimiderend tegenover iedereen, inclusief zijn zoon, die hij vastgebonden houdt. Killer Kane zweert op de bijbel dat hij Max's moeder niet heeft vermoord. Hij onthult ook dat hij van plan is om naar "warmer weer" te gaan en een oplichter te worden. s Nachts laat hij Max alleen, vastgebonden in een kamer in het appartement van een oude dame op vakantie. Loretta, geschokt dat Kane zijn eigen kind zoiets zou aandoen, probeert hem te helpen ontsnappen. Killer Kane vangt haar en begint haar te wurgen. Max probeert hem tegen te houden en onthult dat hij getuige was hoe zijn vader zijn moeder op dezelfde manier vermoordde. Kane geeft het op om Max te trainen als zijn gehoorzame assistent en probeert hem te doden, maar Freak komt net op tijd en redt Max door Kane te bespuiten met een spuitpistool waarvan hij beweert dat het gevuld is met zwavelzuur, terwijl het in feite gevuld is met zeep, azijn, en kerriepoeder. De politie wacht buiten, en Killer Kane gaat terug naar de gevangenis, deze keer tot hij een oude man is.
In de lente na de aanval viert Kevin de verjaardag van hem en Freak de Machtige. Kort daarna sterft Freak in het ziekenhuis nadat hij Max heeft verteld dat hij al hun avonturen moet opnemen. Max wordt gek als hij het nieuws hoort en is woedend op de dokters omdat ze Kevin een robotlichaam hebben beloofd om hem te redden. De dokter legt uit dat dat slechts een verhaal was dat Kevin zichzelf vertelde, en dat hij altijd al wist dat hij jong zou sterven. Hij zocht zijn toestand op in een medisch woordenboek (Freak hield van woorden en droeg altijd een woordenboek bij zich). Max rouwt wekenlang om Freak en wil niet ophouden. Met de aanmoediging van Loretta Lee, begint Max uiteindelijk te genezen en schrijft een boek over de avonturen van Freak de Machtige, in overeenstemming met Freak's laatste wensen.
