Jackson County (county code JA) is een county in de Amerikaanse staat Kansas. In 2010 woonden er 13.462 mensen. De hoofdstad is Holton. Holton is ook de grootste stad in Jackson County. De county heette eerst Calhoun County. Deze werd vernoemd naar de pro-slavernij Zuid-Carolina senator John C. Calhoun. De county werd in 1859 hernoemd naar president Andrew Jackson. Het Prairie Band Potawatomi Indian Reservation ligt in de county, en vormt ongeveer 18,5% van de oppervlakte van de county.