Vroege geschiedenis
In 1539 meldde Marcos de Niza, een broeder, geruchten over Cíbola, een stad van goud, aan de Spaanse koloniale ambtenaren in Mexico-Stad. Volgens Niza lag de stad in het huidige Nieuw-Mexico. Als reactie op de geruchten trok Francisco Vázquez de Coronado twee jaar later met een leger van 3000 Spanjaarden en 8001 Mexicanen vanuit Culiacán noordwaarts in de hoop de stad te vinden. Toen Coronado de stad in New Mexico niet vond, trok hij verder noordoostwaarts de Mississippi-vallei in, waarbij hij het huidige gebied van Kansas schuin overstak. Daarmee waren Conrado en zijn leger de eerste Europeanen die de Great Plains zagen, inclusief Kansas. Later reisde Juan de Oñate in 1601 ook naar Kansas.
In 1682 kregen Jacques Marquette, Louis Jolliet, Louis Hennepin en andere Franse leiders de formele controle over de Mississippi-vallei, inclusief het land dat later Kansas zou worden. Dit land, bekend als het Louisiana territorium, werd gebruikt om de handel met de inheemse Amerikanen te organiseren. In 1763 stond Frankrijk het Louisiana-gebied af aan Spanje.
Tussen 1763 en 1803 werd het grondgebied van Kansas opgenomen in Spaans Louisiana. De gouverneur Luis de Unzaga "le Conciliateur" bevorderde in die periode expedities en goede betrekkingen met de indianenstammen. Onder de ontdekkingsreizigers waren Antoine de Marigny en anderen die de handel over de Kansas-rivier voortzetten, vooral bij de samenvloeiing met de Missouri-rivier, zijrivieren van de Mississippi-rivier.
In 1803 gaf Spanje het grondgebied echter terug aan Frankrijk in het Derde Verdrag van San Ildefonso. Op 30 april 1803 verkocht Napoleon het grondgebied van Louisiana aan de Verenigde Staten in de Louisiana Purchase. In het begin van de jaren 1800 werd Kansas gebruikt om inheemse Amerikanen vast te houden die van hun geboortegrond waren verwijderd.
Statehood
Op 30 mei 1854 ondertekende het Congres de Kansas-Nebraska Act. De Kansas-Nebraska Act verklaarde dat Kansas en Nebraska beide territoria van de Verenigde Staten waren. Ook werd bepaald dat de inwoners van Kansas zouden stemmen over de rechtmatigheid van de slavernij.
Toen ze dit hoorden, kwamen ongeveer 1.200 gewapende New Englanders naar Kansas om tegen slavernij te stemmen. Duizenden zuiderlingen, voornamelijk uit Missouri, kwamen echter voor de slavernij stemmen. Uiteindelijk werd de slavernij legaal en nam Kansas de meeste slavenwetten van Missouri over. In Kansas werd gevochten tussen zuiderlingen en noorderlingen. In één gevecht doodden John Brown en zijn mannen vijf mensen in het Pottawatomie bloedbad. Later verwoestten Zuiderlingen Lawrence, Kansas. Kansas werd "Bloedend Kansas" genoemd.
Tussen 1854 en 1861 stelde Kansas vier grondwetten voor. Van de vier voorgestelde grondwetten stonden er drie geen slavernij toe. Uiteindelijk nam Kansas in juli 1859 de Wyandotte-grondwet aan, die anti-slavernij was. In april 1860 werd de grondwet voor staatsvorming naar de Amerikaanse regering gestuurd om erover te stemmen. De grondwet werd aangenomen door het Huis van Afgevaardigden, maar verworpen door de Senaat. Dit omdat de zuidelijke kiezers in de Senaat het niet goed vonden dat Kansas een staat zonder slavernij zou worden. In 1861, na de vorming van de Geconfedereerde Staten, werd de grondwet goedgekeurd door de Unie en werd Kansas een staat.
Kansas in de Burgeroorlog
Vier maanden nadat Kansas een staat werd, begon de Burgeroorlog. Van de 381 veldslagen in de Burgeroorlog werden er vier in Kansas uitgevochten. Gedurende de hele oorlog bleef Kansas een Unie-staat.
Op 21 augustus 1863 leidde William Clarke Quantrill een troepenmacht van 300 tot 400 geconfedereerden naar de stad Lawrence, Kansas. Quantrill en zijn troepen verbrandden, plunderden en verwoestten de anti-slavernij stad. Deze slag werd bekend als de Lawrence Massacre. In totaal kwamen 164 Unie-soldaten en 40 Confederatie-soldaten om in de Lawrence Massacre. In de Slag om Mine Creek, op 25 oktober 1864, vielen soldaten van de Unie de Geconfedereerden aan toen zij de Mine Creek overstaken. De Unie omsingelde de Geconfedereerden en nam 600 man en twee generaals gevangen. 1.000 confederale soldaten en 100 soldaten van de Unie stierven in de strijd. In totaal stierven of raakten 8.500 mensen uit Kansas gewond in de Burgeroorlog.
Na de burgeroorlog
Na de Burgeroorlog kwamen veel vrije slaven naar Oklahoma en Kansas. Tussen 1879 en 1881 kwamen ongeveer 60.000 Afrikaanse Amerikanen naar deze regio. De slaven wilden namelijk economische kansen, die hen in Kansas te wachten stonden. Afro-Amerikanen kwamen ook naar Kansas voor betere politieke rechten en om te ontsnappen aan de deelpacht. Deze mensen werden "Exodusters" genoemd.
Recente geschiedenis
Vuilnisbak
Van 1930 tot 1936 maakte Kansas een periode door die de Dust Bowl werd genoemd. In deze periode viel er in Kansas weinig regen en waren de temperaturen hoog. Duizenden boeren werden erg arm en moesten verhuizen naar andere delen van de Verenigde Staten. In totaal verlieten 400.000 mensen het Great Plains gebied. De jaren van 1930 tot 1940 was de enige periode waarin de bevolking van Kansas daalde. Het aantal inwoners van Kansas daalde met 4,3 procent.
Brown v. Board of Education of Topeka, Kansas
In de jaren 1950 was schoolsegregatie verplicht in vijftien Amerikaanse staten. Kansas behoorde echter niet tot deze staten. In plaats daarvan was schoolsegregatie toegestaan op lokaal niveau, maar alleen op basisscholen. In 1896 bepaalde de uitspraak van Plessy v. Ferguson dat segregatie was toegestaan, maar dat er voor zwarten en blanken gelijke faciliteiten beschikbaar moesten zijn. Vaak kregen zwarte scholen echter minder geld en minder schoolboeken dan blanke scholen.
Om deze redenen klaagden Linda Brown en haar familie de Onderwijsraad van Topeka, Kansas aan. Brown won de zaak, en de uitspraak maakte het Plessy v. Ferguson-besluit ongedaan. Dit werd door velen beschouwd als een mijlpaal in de burgerrechtenbeweging.