Metroid Prime Hunters is een first-person actie-avonturen video game voor de Nintendo DS console. Het is ontwikkeld door Nintendo Software Technology en gepubliceerd door Nintendo. Het werd uitgebracht in Noord-Amerika op 20 maart 2006, in Europa op 5 mei 2006 en in Japan op 1 juni 2006. Toen de Nintendo DS in 2004 werd gelanceerd, bevatte het een vroege demo van Metroid Prime Hunters, die op dat moment de titel Metroid Prime Hunters kreeg: Eerste Hunt.

Net als andere titels in de Metroid Prime serie, Metroid Prime Hunters is een first-person adventure game waar de focus ligt op exploratie en ontdekking. Het verschilt echter van andere titels in die zin dat er geen geholpen richten is, een grotere focus op gameplay, en online multiplayer. Samus Aran, de hoofdpersoon die de speler speelt, kan overal vandaan toegang krijgen tot haar wapenschip. Het spel maakt gebruik van beide schermen van de Nintendo DS: het bovenste scherm wordt gebruikt om de gezondheid van Samus en de hoeveelheid van een wapen die nog over is te laten zien, terwijl het onderste scherm de radar laat zien. De speler beweegt Samus met de D-pad, en het richten gebeurt met behulp van het touchscreen op het onderste scherm van de Nintendo DS.

Online multiplayer kan met maximaal vier spelers worden gespeeld. Spelers kunnen spelen als Samus of als één van de zes premiejagers. Elke premiejager heeft verschillende vormen en wapens. De gastheer van het spel is in staat om opties in te stellen voor punten en tijdslimieten en om te bepalen of spelers de radar kunnen gebruiken of niet. Als minder dan vier spelers deelnemen aan een spel, worden er computergestuurde karakters in het spel geplaatst. In multiplayer toont het onderste scherm het aantal doden dat een speler heeft gemaakt en de resterende tijd in de ronde.