Auto-Tune werd gebruikt voor vocale effecten op Cher's "Believe", opgenomen in 1998. Dit was de eerste grote hit waarbij de software voor dit doel werd gebruikt. Aanvankelijk beweerden de geluidstechnici dat zij een vocoder hadden gebruikt, in wat volgens Sound on Sound een poging was om een bedrijfsgeheim te bewaren. Na het enorme succes van "Believe" kopieerden veel artiesten de techniek, die bekend werd als het "Cher Effect". Het is te horen in nummers van eind jaren 1990 en begin jaren 2000. Enkele opmerkelijke voorbeelden zijn Gigi D'Agostino's "La Passion" en Janet Jackson's Amerikaanse nummer 1-hit "All For You". Auto-Tune werd opnieuw beroemd in het midden van de jaren 2000 toen R&B zanger T-Pain er actief gebruik van maakte in zijn nummers. Deze techniek werd gekopieerd door vele andere moderne R&B en popartiesten, waaronder Usher, Beyoncé, Rihanna, en Justin Bieber. T-Pain heeft zelfs een iPhone App naar zich laten vernoemen die het effect kopieert, genaamd "I Am T-Pain".
De Boston Herald onthulde dat country muzieksterren Faith Hill en Tim McGraw beiden hebben gezegd dat ze Auto-Tune gebruiken bij optredens. Ze zeiden dat het een vangnet is dat een goed optreden garandeert. Sara Evans, John Michael Montgomery en Gary LeVox van de groep Rascal Flatts gebruiken ook Auto-Tune om problemen met de toonhoogte te verhelpen. Andere zangers van countrymuziek, zoals Loretta Lynn, Allison Moorer, Trisha Yearwood, Vince Gill, Garth Brooks, Martina McBride, en Patty Loveless, hebben echter geweigerd Auto-Tune te gebruiken.
De YouTube-muziekgroep The Gregory Brothers heeft hun originele muzieknummers aangevuld met automatisch gestemde versies van alledaagse nieuwsvideo's. Ze steken de draak met iedereen, van president Barack Obama tot Antoine Dodson. De populariteit van hun YouTube-kanaal heeft ertoe geleid dat de Gregory Brothers veel van hun nummers op iTunes hebben uitgebracht.
Tegenreactie van artiesten
In 2002 werd de cd Miss Fortune van singer-songwriter Allison Moorer uitgebracht met een sticker waarop stond: "Absolutely no vocal tuning or pitch correction was used in the making of this record". Tijdens de 51e Grammy Awards begin 2009 droeg de band Death Cab for Cutie blauwe linten om te protesteren tegen het gebruik van Auto-Tune in de muziekindustrie. Later dat voorjaar noemde Jay-Z de leadsingle van zijn album The Blueprint 3 "D.O.A. (Death of Auto-Tune)". Jay-Z zei dat veel te veel mensen op de Auto-Tune bandwagon waren gesprongen en dat de trend een gimmick was geworden. Christina Aguilera verscheen in het openbaar in Los Angeles op 10 augustus 2009 en droeg een T-shirt met de tekst: "Auto Tune is for Pussies". Echter, toen ze geïnterviewd werd door Sirius/XM, zei ze dat Auto-Tune niet slecht was als het "...op een creatieve manier" gebruikt werd. Ze zei dat haar album Bionic gebruik maakt van de technologie en benadrukte dat "Elastic Love" er een product van is.