Het eerste deel van de metro, verving een zeer drukke tramroute, en volgde Yonge Street van Eglinton Avenue zuid naar Front Street, en draaide vervolgens naar het westen voor een blok om te eindigen bij Bay Street, naast het hoofdstation van de stad Union Station en dus werd het metrostation ook wel Union genoemd. Deze lijn werd voltooid in 1954 en was 7,4 km lang.
In 1963 werd een ander deel toegevoegd, dat naar het noorden ging vanaf het station van Union, onder University Avenue en Queen's Park naar de buurt van Bloor Street, waar het naar het westen draaide om te eindigen bij St.
De Bloor-Danforth Lijn werd in 1966 geopend langs Bloor Street en Danforth Avenue van Keele Street tot Woodbine Avenue, en werd in 1968 langer gemaakt om te lopen van Islington Avenue tot Warden Station in Warden en St.
De route van de lijn over de Don-vallei was mogelijk door een keuze die meer dan veertig jaar eerder werd gemaakt. Toen het Prins Edward Viaduct in 1919 aan de overkant van de Don werd gebouwd, werden er twee dekken onder de weg ontworpen om toekomstige spoorlijnen mogelijk te maken. Hierdoor kon de metro de Donvallei oversteken naar Danforth Avenue aan de oostzijde.
De Yonge-Universiteitslijn werd in 1973 en 1974 uitgebreid naar het noorden, 8,7 km van Eglinton Avenue naar Finch Avenue en Yonge.
Meer spoor (9,9 km) werd toegevoegd aan de Yonge-University Line in 1978 toen het werd uitgebreid van St. George en Bloor, naar het noorden en noordwesten naar Eglinton Avenue en Allen Road, dan naar het noorden langs het midden van Allen Road naar Wilson Avenue.
In oktober 1976 vernielde een brandstichting (een opzettelijke brandstichting) de metro's en de schade aan het Christie-station. Dit veroorzaakte de sluiting van de Bloor-Danforth Lijn voor drie dagen, en sloot het Christie station voor enige tijd voor reparaties. In 1980 werd aan beide uiteinden van de Bloor-Danforth Lijn meer spoor toegevoegd. Deze uitbreidingen voegden elk een station, bushaltes en, aan het oostelijke uiteinde, ruimte toe om verbinding te maken met de Scarborough RT.
Met zes stations op 6,8 km spoor is de Scarborough RT een lijn die bijna allemaal boven de grond is gebouwd, en die geen directe sporen heeft die aansluiten op de andere lijnen en gebruik maakt van een andere trein. Het maakt gebruik van het Intermediate Capacity Transit System (ICTS) treinen die zeer verschillend zijn van de metro's. Het traject is volledig gescheiden van het wegverkeer en de voetgangers, de stations zijn volledig overdekt, en de treinen hebben veel deuren die gebruik maken van hoge perrons.
Aan de noordkant van het Spadina-gedeelte van de Yonge-University-Spadina-lijn is 1,6 km extra toegevoegd, met een station (Downsview), met parkeergelegenheid voor bussen.
In augustus 1995 kreeg het TTC een heel slecht metro-ongeluk in wat het het Russell Hill ongeluk noemt, op de Yonge-University-Spadina Lijn ten zuiden van het station St. Clair West. Drie vrouwen kwamen om het leven en 100 mensen raakten gewond, een paar ernstig.
De nieuwste lijn van de metro, Sheppard, werd geopend in 2002. Hij loopt 5,5 km naar het oosten, onder Sheppard Avenue van het station Sheppard op de Yonge-lijn (nu Sheppard-Yonge genoemd), naar het station van Don Mills in Sheppard en Don Mills Road. De Sheppard lijn heeft minder gebruikers dan de andere twee metrolijnen, en er rijden kortere treinen op.
In zijn meer dan vijftigjarige geschiedenis werd pas op 6 februari 2006 de eerste baby geboren op een perron van een TTC-metrostation. Dit incident vond plaats op het station van Wellesley en veroorzaakte vertragingen in het metrosysteem. Het was voorpaginanieuws gedurende vele dagen.
Een automatisch stemsysteem werd toegevoegd om elk station aan te kondigen (zoals; "Het volgende station is Bloor, Bloor station.") waardoor de treinoperator elke halte niet meer hoeft aan te kondigen. Het geautomatiseerde systeem wordt gebruikt in de hele metro en het RT systeem.
