Joseph Kony (uitgesproken als IPA: [koɲ]; geboren in 1961) is een Oegandese guerrillagroepsleider. Hij is het hoofd van het Verzetsleger van de Heer (LRA). Terwijl hij veel steun kreeg van het publiek, keerde de LRA zich tegen haar aanhangers. Ze zeiden dat ze dit deden om het Acholi-volk te "zuiveren" en van Oeganda een theocratie te maken die geregeerd wordt door de Tien Geboden.

De LRA staat bekend om de zeer slechte dingen die het doet met burgers. Twee van die dingen zijn moord en verkrachting.

De LRA is bekend geworden om wat het doet tegen de bevolking van verschillende landen. Enkele van deze landen zijn Noord-Oeganda, de Democratische Republiek Congo, de Centraal-Afrikaanse Republiek, Zuid-Soedan en Soedan. Het heeft ongeveer 66.000 kinderen gestolen en gedwongen voor hen te vechten.

In 2005 werd Kony door het Internationaal Strafhof in Den Haag beschuldigd van oorlogsmisdaden. Hij is nog niet gevangen genomen.