Wat nu Zuid-Soedan is, maakte ooit deel uit van het Anglo-Egyptische Soedan. Dit deel van het Britse Rijk werd de Republiek Soedan toen in 1956 onafhankelijkheid werd bereikt. Na de eerste Soedanese burgeroorlog werd in 1972 de autonome regio Zuid-Soedan gevormd, die tot 1983 standhield. Al snel ontwikkelde zich een tweede Soedanese burgeroorlog, die eindigde met het alomvattende vredesakkoord van 2005. Later dat jaar werd de Autonome Regering van Zuid-Sudan gevormd. Zuid-Sudan werd een onafhankelijke staat op 9 juli 2011 om middernacht plaatselijke tijd, na een referendum dat in januari 2011 werd gehouden. In het referendum wilde bijna 99% van de stemmers zich afscheiden van de rest van Sudan.
De Veiligheidsraad van de Verenigde Naties is op 13 juli 2011 bijeengekomen om het lidmaatschap van de Republiek Zuid-Sudan formeel te bespreken. De volgende dag, 14 juli 2011, werd Zuid-Sudan een lidstaat van de Verenigde Naties. Zuid-Sudan heeft ook een aanvraag ingediend om lid te worden van het Gemenebest van Naties, de Oost-Afrikaanse Gemeenschap, de Intergouvernementele Ontwikkelingsautoriteit, het Internationaal Monetair Fonds en de Wereldbank. Het land kwam ook in aanmerking om het lidmaatschap van de Arabische Liga aan te vragen.
Op de Olympische Zomerspelen van 2012 nam één atleet uit Zuid-Sudan deel onder de vlag van het Internationaal Olympisch Comité. In 2013 brak een burgeroorlog uit.
