Hij gaf les aan de State University of New York in Geneseo van 1972 tot 1978. Hij kreeg een beurs van de Alexander von Humboldt Stichting, zodat hij van 1978 tot 1980 wiskunde ging doceren aan de Ruprecht Karl Universiteit van Heidelberg. Daarna gaf hij van 1980 tot 1982 les aan het Randolph-Macon Women's College in Lynchburg, Virginia. Vervolgens probeerde hij vier jaar lang fulltime auteur te zijn. Geïnspireerd door een interview met Stephen Wolfram werd Rucker in 1986 hoogleraar computerwetenschappen aan de San José State University. Hij ging in 2004 met pensioen bij SJSU. Hij is een wiskundige die ook geïnteresseerd is in filosofie. Hij heeft boeken geschreven die deze twee gebieden met elkaar verbinden, bijvoorbeeld: The Fourth Dimension; Geometry, Relativity and the Fourth Dimension; en Infinity and the Mind. Princeton University Press publiceerde nieuwe edities van Infinity and the Mind in 1995 en in 2005, beide met nieuwe voorwoorden; de eerste editie wordt redelijk vaak geciteerd in de academische literatuur.
Als zijn "eigen alternatief voor cyberpunk" ontwikkelde Rucker een schrijfstijl die hij Transrealisme noemt. Hij gaf een korte uitleg van het Transrealisme in zijn essay uit 1983, The Transrealist Manifesto. Het is sciencefiction gebaseerd op het eigen leven en de directe waarnemingen van de auteur, vermengd met fantastische elementen die psychologische verandering symboliseren. Veel van Ruckers romans en korte verhalen passen deze ideeën toe. Een voorbeeld van Ruckers transrealistische werken is Saucer Wisdom, een roman waarin de hoofdpersoon wordt ontvoerd door buitenaardse wezens. Rucker en zijn uitgever brachten het boek als een soort grap op de markt als non-fictie.
Rucker schreef zijn eerste transrealistische roman, Wit licht, toen hij in Heidelberg zat. Deze transrealistische roman is gebaseerd op zijn ervaringen aan de SUNY Geneseo.
Rucker gebruikt zijn romans vaak om wetenschappelijke of wiskundige ideeën te onderzoeken. Zo wordt in Wit licht het begrip oneindigheid onderzocht. Delen van de Ware Tetralogie (geschreven van 1982 tot 2000) zijn een uitleg van het gebruik van natuurlijke selectie om computersoftware te ontwikkelen (een onderwerp dat ook is uitgewerkt in zijn The Hacker and the Ants, geschreven in 1994). Zijn romans getuigen ook van een mystieke filosofie. Rucker legde deze filosofie uit in een essay genaamd The Central Teachings of Mysticism. Deze titel kan enige ironie bevatten (het essay is opgenomen in Seek!, 1999).
Hij heeft onlangs een boek gepubliceerd met de titel The Lifebox, the Seashell, and the Soul: What Gnarly Computation Taught Me About Ultimate Reality, the Meaning Of Life, and How To Be Happy. Dit boek vat de verschillende filosofieën samen die hij in de loop der jaren heeft geloofd. Het eindigt met de voorzichtige conclusie dat mensen enig voordeel zouden kunnen halen uit het denken over de wereld als opgebouwd uit berekeningen. Zijn laatste opmerking in het boek is: "misschien is dit universum wel perfect."
