Het Huis van Braganza werd gesticht in 1442. Toen werd Afonso, 8e graaf van Barcelos, hertog van Braganza. Alfonso (Alfonso I) was een buitenechtelijke zoon van koning João I van Portugal, van het Huis van Aviz. Hij werd hertog door zijn neef, koning Afonso V van Portugal. De feodale hertogen verzamelden al snel een fortuin aan eigendommen, titels en macht. Tegen het midden van de jaren 1600 was het Huis het machtigste van heel Portugal. Het was ook een van de grootste huizen van Iberië.
Het Huis van Braganza werd het eerste regerende huis van Brazilië, toen in 1815 het Verenigd Koninkrijk van Portugal, Brazilië en de Algarven werd opgericht. Het Verenigd Koninkrijk bleef bestaan tot 1822, toen het Braziliaanse Rijk onafhankelijk werd van Portugal. De nieuwe Braziliaanse natie werd geleid door Prins Pedro van Braganza, erfgenaam van de Portugese troon, die regeerde als Keizer Pedro I van Brazilië, en als Koning Pedro IV van Portugal. Tot 1835 stonden de Portugese Braganza's nog in de lijn van opvolging voor de Braziliaanse troon. Het Huis werd afgezet (verwijderd) van de Braziliaanse troon, in 1889, toen Brazilië werd uitgeroepen tot republiek.
Het Huis bleef het claimende huis voor de Braziliaanse troon tot 1921. Toen overleed Isabel, keizerlijke prinses van Brazilië, dochter van keizer Pedro II van Brazilië. Haar aanspraak ging over op haar zoon, Prins Pedro Henrique van Orléans en Braganza. Zo werd het Huis van Orléans-Braganza het claimende huis van de vroegere monarchie van Brazilië. Pedro Henrique overleed in 1981. De huidige erfgenaam is zijn oudste zoon, prins Luiz.
In Portugal werd koning Carlos I van Portugal in 1908 vermoord. Ook zijn oudste zoon kwam bij de aanslag om het leven. Zijn jongere zoon, Manuel II, werd koning. Toen in 1910 de Portugese Republiek werd opgericht, gingen koning Manuel II en de rest van de Braganza's in ballingschap.