Binaire splijting ("splitsing in tweeën") is een soort aseksuele voortplanting. Het is de meest voorkomende vorm van voortplanting bij prokaryoten zoals bacteriën. Het komt voor in sommige eencellige Eukaryoten zoals de Amoebe en het Paramoecium. Bij binaire splijting komen DNA-replicatie en -segregatie tegelijkertijd voor.
Bij binaire splijting splitst de volgroeide oudercel zich in twee helften, waardoor er twee bassins ontstaan. Na het repliceren van zijn genetisch materiaal, deelt de oudercel zich in twee even grote dochtercellen. Het genetisch materiaal wordt gerepliceerd en vervolgens gelijkelijk gesplitst. De dochtercellen zijn genetisch identiek (tenzij er tijdens de replicatie een mutatie optreedt).

Tijdens binaire splijting verdeelt het DNA-molecuul zich en vormt het twee DNA-moleculen. De cel groeit dan om ruimte te creëren voor elk molecuul om zich naar de andere kant van de bacterie te bewegen. Tegelijkertijd deelt het celmembraan zich om 2 dochtercellen te vormen. Na de deling groeien de nieuwe cellen en herhaalt het proces zich.
Binaire splitsing komt voor in eukaryote weefselcellen, maar het proces is ingewikkelder: zie mitose.
In principe kopieert een cel zijn DNA, en splitst dan het midden op, waardoor er twee dochtercellen ontstaan.