In de kolonie Plymouth kregen de kolonisten land. Bij die verdeling van land in 1623 kreeg Cooke twee acres, één voor hemzelf en één acre voor zijn zoon John. Hij kreeg ook 4 acres voor zijn vrouw en kinderen die in 1623 met het schip Anne waren overgekomen.
Cooke's kinderen heetten John, Jacob, Jane, Hester en Mary.
Cooke scheen te worden vertrouwd en gewaardeerd door de andere kolonisten, want in het begin van 1633 werd Cooke door het hof aangewezen om een geschil van financiële aard tussen Peter Browne en Dr. Samuel Fuller te helpen oplossen.
In 1640/41 was Cooke een van de twaalf mannen die door het hof werden belast met het maken van officiële reisroutes, en het maken van een formeel overzicht en het markeren van de grenzen van percelen land en voor de rivier Jones. In 1645 was hij opnieuw wegopzichter voor Plymouth. In juni 1650, toen hij bijna zeventig was, deed hij nog steeds landmeetkundig werk. In augustus 1659, toen hij achter in de zeventig was, werd hij opnieuw door de rechtbank van Plymouth opgeroepen om te helpen bij het beslissen over een grensgeschil tussen Thomas Pope en William Shurtliff.
Cooke deed ook ander werk voor de overheid, hij zat in verschillende kleine en grote jury's. Tot maart 1643 maakte hij ook deel uit van jury's voor civiele zaken. De meeste civiele zaken betroffen schulden of laster. Hij zat ook in jury's in 1638, 1640, 1642 en 1643, waar het om zwaardere misdrijven ging.
In de "Able to Bear Arms List" van 1643 worden Francis Cooke en zijn zonen Jacob en John Jr. genoemd bij die uit Plymouth.
Op 7 december 1659 maakte Francis Cooke zijn testament op, zeggende dat hij zwak van lichaam was. Het testament was zeer eenvoudig en hij schonk alles aan Hester, zijn liefhebbende vrouw. 1609.
Francis Cooke overleed in Plymouth op 7 april 1663 en werd begraven op Burial Hill in Plymouth, Massachusetts.