Big Boss is een terugkerend personage in de Metal Gear serie van videogames, die dient als een held of schurk. Hij is degene die de genen gaf om drie klonen van zichzelf te maken, Solid Snake, Liquid Snake en Solidus Snake. In zekere zin maakt dit hem tot hun vader. Hij begint als soldaat voor het CIA special forces team, de FOX Unit. Later creëert en leidt hij zelf een special forces team, FOXHOUND.
In Metal Gear Solid 3 redt Big Boss tevergeefs de wetenschapper Sokolov, omdat zijn mentor, de Boss, van kant verandert van de Verenigde Staten naar de Sovjet-Unie. In het begin begreep hij niet waarom. Later wordt uitgelegd dat de regering haar beval om van kant te veranderen, omdat zij de enige soldaat was die Volgin zou respecteren en vertrouwen genoeg om de erfenis van de Filosofen te behouden tijdens de Tweede Wereldoorlog. De Baas herenigt zich later met haar voormalige team van medesoldaten, de Cobra-eenheid. Ze wist dat Big Boss, die in het spel Naked Snake heette, haar zou moeten doden als onderdeel van zijn missie, maar ze wilde haar doel doorgeven om hem te voltooien. Nadat hij de echte reden voor de dood van de Baas heeft ontdekt, verliest hij zijn patriottisme en wil hij de wereld verenigen onder één regering. Dit is zodat de regeringen van de wereld niet zouden dreigen om elkaar te vernietigen met kernwapens. De regering geeft hem een nieuwe codenaam, Big Boss. Hij heeft een hekel aan de codenaam, omdat die hem eraan herinnerde dat hij die kreeg voor het doden van de Baas. Ze was een van de enige waar hij echt om gaf.
In Metal Gear 1 & 2, Big Boss probeert Metal Gear te gebruiken om de regeringen van de wereld te vernietigen, maar FOXHOUND agent Solid Snake (die ook een van Big Boss's klonen is) vernietigt het en stopt hem.