Louise Leakey (geboren 21 maart 1972) is een Keniaanse paleontologe. Zij doet onderzoek en veldwerk naar menselijke fossielen in Oost-Afrika.
Louise raakte voor het eerst actief betrokken bij fossielenvondsten in 1977, toen zij zes jaar oud was en de jongste persoon werd die hominide fossielen vond. In 1993 verving zij haar vader Richard Leakey als expeditieleider voor de paleontologische Turkana-expedities, in een van de meest dorre en vijandige omgevingen op aarde.
Tegenwoordig leidt zij, samen met haar moeder, Meave Leakey, het Koobi Fora onderzoeksproject. Dit heeft enkele van de meest opmerkelijke fossiele hominidenvondsten van de afgelopen twee decennia opgeleverd, met als meest recente de Kenyanthropus platyops.
Louise Leakey werd in 1972 in Kenia geboren, in hetzelfde jaar waarin haar grootvader Louis Leakey overleed. Ze trouwde in 2003 met Emmanuel de Merode, een Belgische primatoloog. Zij hebben twee dochters: Seiya, geboren in 2004, en Alexia, geboren in 2006.