John Howard Northrop (5 juli 1891 - 27 mei 1987) was een Amerikaans biochemicus. Hij deelde de Nobelprijs voor scheikunde in 1946 met James Batcheller Sumner en Wendell Meredith Stanley.

Northrop werd in 1949 verkozen tot Fellow van de American Academy of Arts and Sciences. Hij was werkzaam bij het Rockefeller Instituut voor Medisch Onderzoek in New York City van 1916 tot aan zijn pensionering in 1961. In 1949 werd hij benoemd tot Professor Bacteriologie en later tot Professor Biofysica aan de Universiteit van Californië, Berkeley.