Myco-heterotrofie is een relatie tussen bepaalde planten en schimmels. De plant haalt zijn voedsel geheel of gedeeltelijk uit parasitisme op schimmels, niet uit fotosynthese.
In het verleden dacht men dat niet-fotosynthetische planten voedsel kregen door organisch materiaal af te breken, zoals schimmels dat doen. Zulke planten werden daarom "saprofyten" genoemd. Dat was onjuist. Het is nu bekend dat geen enkele plant fysiologisch in staat is tot directe afbraak van organisch materiaal.
Om aan voedsel te komen, gaan niet-fotosynthetische planten over tot parasitisme, door myco-heterotrofie of directe parasitering van andere planten.
Het raakvlak tussen de plant en de schimmelpartners in deze associatie ligt tussen de wortels van de plant en het mycelium van de schimmel. Myco-heterotrofie lijkt dus sterk op mycorrhiza, en men denkt dat zij uit mycorrhiza is voortgekomen.
