Pterodaustro was een pterosaurus. Het is gevonden in het Lagere Krijt van Zuid-Amerika. Pterodaustro voedde zich waarschijnlijk met kleine ongewervelde dieren: zoöplankton en krill.
Pterodaustro was middelgroot, met een spanwijdte van ongeveer twee meter en alleen gevonden in Brazilië.
Pterodaustro waadde waarschijnlijk in ondiep water zoals flamingo's, en zeefde voedsel met zijn tandenkam, een methode die "filtervoeding" wordt genoemd. Eens zijn voedsel gevangen, stampte Pterodaustro het waarschijnlijk met de kleine, bolvormige tanden aanwezig in zijn bovenkaak.
Ten minste twee exemplaren zijn gevonden met maagstenen in de maagholte, de eerste die ooit voor een pterosaurus zijn gemeld. Deze clusters van kleine stenen met schuine randen ondersteunen het idee dat Pterodaustro voornamelijk kleine, harde schaalvormige aquatische schaaldieren at door middel van filtervoeding. Dergelijke ongewervelden zijn overvloedig aanwezig in het sediment van de fossiele site
In 2004 werd melding gemaakt van een Pterodaustro-embryo in een ei. Het ei was langwerpig, zes centimeter lang en 22 millimeter breed en de voornamelijk flexibele schaal was bedekt met een dunne laag calciet van 0,3 mm dik.
Vergelijkingen tussen de scleral ringen (benige ring rond de oogrand) van Pterodaustro en moderne vogels en reptielen suggereren dat het nachtdieren kunnen zijn geweest, en dat ze soortgelijke activiteitenpatronen kunnen hebben gehad als de moderne eenden die 's nachts eten.