Cyanobacteriën zijn een taxon van bacteriën die de fotosynthese uitvoeren. Het zijn geen algen, hoewel ze ooit blauw-groene algen werden genoemd. Het is een phylum van bacteriën, met ongeveer 1500 soorten. In de endosymbiont theorie stammen chloroplasten (plastiden) af van cyanobacteriën. Hun DNA-profiel is daar het bewijs van.
Cyanobacteriën hebben een extreem lang fossielenbestand, dat minstens 3.500 miljoen jaar geleden begon. Zij waren de belangrijkste organismen in de stromatolieten van de Archeologische en Proterozoïsche eonen.
Het vermogen van cyanobacteriën om zuurstofrijke fotosynthese uit te voeren is zeer belangrijk. De vroege atmosfeer op aarde werd grotendeels gereduceerd, dat wil zeggen, zonder zuurstof. De cyanobacteriën in stromatolieten waren de eerste bekende organismen die fotosynthese uitvoerden en vrije zuurstof produceerden. Na ongeveer een miljard jaar begon het effect van deze fotosynthese een enorme verandering in de atmosfeer. Het proces, dat de Great Oxygenation Event wordt genoemd, nam veel tijd in beslag. Uiteindelijk doodde het de meeste organismen die niet in zuurstof konden leven, en leidde het tot het soort milieu dat we nu kennen, waar de meeste organismen zuurstof gebruiken en nodig hebben.



