Ecologie
Algen komen meestal voor op vochtige plaatsen of in water, en komen zowel op het land als in het water voor. Algen op het land zijn echter meestal onopvallend en komen veel vaker voor in vochtige, tropische gebieden dan in droge. Algen hebben geen vaatweefsel en andere aanpassingen om op het land te leven, maar ze kunnen droogte en andere omstandigheden verdragen in symbiose met een schimmel als korstmos.
De verschillende soorten algen spelen een belangrijke rol in de aquatische ecologie. Microscopische vormen die in de waterkolom leven, worden fytoplankton genoemd. Zij vormen de voedselbasis voor de meeste mariene voedselketens. Kelp groeit vooral in ondiep zeewater. Sommige worden gebruikt als menselijk voedsel of geoogst voor agar of kunstmest. Kelp kan groeien in grote kelpwouden. Deze bossen voorkomen een deel van de schade door golven. Er leven veel verschillende soorten in, waaronder zee-egels, zeeotters en abalone.
Sommige algen kunnen schadelijk zijn voor andere soorten. Sommige algen kunnen zich sterk vermeerderen en een algenbloei veroorzaken. Deze algen kunnen beschermende gifstoffen maken die vissen in het water doden. Dinoflagellaten maken een verbinding die het vlees van vissen in slijm verandert. Vervolgens eten de algen deze voedzame vloeistof op.
Symbiose
Algen hebben een aantal symbiotische partnerschappen met andere organismen ontwikkeld. De bekendste is het plantachtige korstmos, dat wordt gevormd door een schimmel met een alg. Het is een zeer succesvolle levensvorm, en er zijn twintigduizend "soorten" bekend. In alle gevallen verschillen de korstmossen qua uiterlijk en levenswijze van beide bestanddelen; het is mogelijk de meest complete symbiose die we kennen. Beide bestanddelen profiteren van hun toegang tot niches met een lage voedingswaarde, waar korstmossen voorkomen.
Minder bekend zijn de relaties van algen met dieren. Rifbouwende koralen zijn in feite sociale Cnidaria-poliepen. Koralen zijn afhankelijk van licht, want de algen zijn belangrijke partners, en zij hebben licht nodig. Koralen hebben structuren ontwikkeld, vaak boomachtig, die de algen maximale toegang tot licht bieden. Het koraal verzwakt de celwanden van de algen en verteert ongeveer 80% van het door de algen gesynthetiseerde voedsel. De afvalproducten van het koraal leveren voedingsstoffen voor de algen, dus net als bij korstmossen profiteren beide partners van de associatie. De algen zijn goudbruine flagellaatalgen, vaak van het geslacht Symbiodinium. Een merkwaardig kenmerk van het partnerschap is dat het koraal de algen in moeilijke tijden kan uitwerpen, en ze later weer terug kan krijgen. Het uitwerpen van de algenpartner wordt bleken genoemd, omdat het koraal zijn kleur verliest.p200
Andere soorten Cnideria, zoals zeeanemonen en kwallen, bevatten ook algen. Kwallen met algen gedragen zich zo dat hun partners overdag het beste licht krijgen, en dalen 's nachts af naar de diepte, waar het water rijk is aan nitraten en bruin van de rotting. Zeeslakken en kokkels staan er ook om bekend dat ze algen herbergen. Beide groepen zijn weekdieren. De zeeslakken grazen op koraal, en hebben dezelfde kleur als het koraal dat ze begrazen. Ze zijn in staat om de algen te scheiden van de poliepweefsels die ze verteren. De algencellen worden verplaatst naar hun tentakels, waar ze verder leven. De anders weerloze slak krijgt zo zowel camouflage als voeding.p204 De reuzenmossel bewaart algen in zijn mantel, die zichtbaar wordt als de mossel open is. De gekleurde mantel heeft plaatsen waar de huid doorzichtig is, en werkt als een lens om het licht te concentreren op de algen eronder. Als de algen te talrijk worden, verteert de mossel ze.p203
Verschillende andere groepen ongewervelde zeedieren hebben leden die een symbiose aangaan met algen. Platwormen (Platyhelminths) en Polychaete wormen (Annelids) zijn twee van dergelijke groepen.