Eerste ideeën en planning
Chen Yu, die van 1957 tot 1967 gouverneur van Guangdong was, had voor het eerst een idee voor een metrosysteem in Guangzhou. In 1960 liet hij het grondwaterpeil van Guangzhou controleren. In 1965 brachten Chen Yu en Tao Zhu het idee naar buiten om in Guangzhou een tunnel aan te leggen voor evacuaties tijdens een oorlog of voor de aanleg van een metro. Het project werd "Project Negen" genoemd.
Het metrosysteem zou twee lijnen moeten hebben. Chen Yu plande een noord-zuid lijn en een oost-west lijn. De plannen voor deze lijnen lijken veel op die van Lijn 1 en Lijn 2. De oost-west lijn is nooit gebouwd. De noord-zuid lijn zou worden gebouwd door Project Negen. Er was niet genoeg tijd, geld of materiaal, dus in plaats van een metro, wilde men trolleybussen gebruiken. De tunnel was klaar in 1966, maar kon niet worden gebruikt. Dit kwam omdat er een onveilig deel van de tunnel was. Er waren vele pogingen om Project Negen opnieuw op te starten in de jaren 1970, maar geen van deze pogingen bracht Project Negen weer op gang.
Aanleg van Lijn 1
Het metroproject ging van start als het Voorbereidingsbureau van de Guangzhou Metro. Het werd in 1979 opgericht om te proberen Project Negen nieuw leven in te blazen. Het project zou helpen het verkeer in Guangzhou te verminderen. Voor de jaren '80 waren de meeste ondergrondse projecten in China bedoeld als voorbereiding op een oorlog. Dit was de eerste keer dat iets als de Guangzhou Metro gericht was op het verkeer. China en Frankrijk werkten samen om de metro te ontwerpen. Vier ontwerpen werden op 14 maart 1988 in de Guangzhou Daily gepubliceerd. Eén van de ontwerpen werd gekozen na het krijgen van feedback van andere mensen. Het toonde een ontwerp dat Lijn 1 en Lijn 2 zou worden.
De aanleg van Lijn 1 begon officieel op 28 december 1992. Voordien, in oktober 1992, begonnen de arbeiders aan een proefgedeelte van de lijn. Bij de aanleg van de metro werden veel bouwtechnieken gebruikt. Deze waren nieuw voor China en omvatten afgezonken buizen en tunnelboormachines. Lijn 1 had 12,75 miljard yen nodig om te worden aangelegd en het stadsbestuur van Guangzhou bracht al het geld bijeen. De toenmalige burgemeester Li Ziliu wilde gebruik maken van cut-and-cover tunnels. Dit betekende dat bijna 100.000 mensen hun huizen moesten verlaten en dat bijna 1,1 km2 aan gebouwen moest worden verwoest.
Op 28 juni 1997 werd het 5,4 km lange deel van Lijn 1 geopend voor een proefrit. Het deel van 13 km dat niet werd geopend, werd op 28 december 1998 voltooid. De hele lijn werd tussen 16 februari en 2 maart 1999 opengesteld voor bezichtiging. Lijn 1 werd officieel geopend op 28 juni 1999.