De Baai van San Francisco is een ondiepe, productieve riviermonding waardoor ongeveer veertig procent van Californië wordt afgevoerd en die in de rivieren Sacramento en San Joaquin stroomt vanuit de bergen van de Sierra Nevada en Central Valley. Technisch gezien stromen beide rivieren in de baai van Suisun, die door de Straat van Carquinez stroomt om de Napa rivier bij de ingang van de baai van San Pablo te ontmoeten, die aan de zuidkant met de baai van San Francisco is verbonden, hoewel de hele groep onderling verbonden baaien vaak "de baai van San Francisco" wordt genoemd.
San Francisco Bay ligt in de Amerikaanse staat Californië en is omgeven door een regio die bekend staat als de San Francisco Bay Area, dat is in de buurt van de grote steden San Francisco, Oakland en San Jose.
De baai heeft een oppervlakte tussen 400 [1] en 1.600 [2] vierkante mijl (1.040 tot 4.160 vierkante kilometer), afhankelijk van welke subbaaien (zoals de baai van San Pablo), estuaria, wetlands, enz. in de meting zijn opgenomen.
