Tandem herhaling
Tandemherhalingen komen voor in DNA wanneer een patroon van nucleotiden wordt herhaald. De herhalingen liggen naast elkaar, in tandem. Dit zijn meerdere kopieën van dezelfde basenpaarsequentie die achter elkaar liggen.
Een voorbeeld is: ATTCG ATTCG ATTCG waarin de reeks ATTCG drie keer wordt herhaald.
Terminologie
Als er tussen 10 en 60 nucleotiden worden herhaald, wordt het een minisatelliet genoemd. Die met minder worden microsatellieten of "korte tandemherhalingen" genoemd.
Wanneer precies twee nucleotiden worden herhaald, spreekt men van een dinucleotide herhaling (bijvoorbeeld: ACACACAC...).
Wanneer drie nucleotiden worden herhaald, spreekt men van een trinucleotide herhaling (bijvoorbeeld: CAGCAGCAGCAG...). Afwijkingen in dergelijke gebieden kunnen leiden tot trinucleotide herhalingsstoornissen.
Het kopienummer van de herhalingseenheid kan variabel zijn. Dit is een variabel aantal tandemherhalingen (VNTR).
Gebruikt
Een tandemherhalingspatroon helpt de erfelijke eigenschappen van een individu te bepalen. Tandemherhalingen kunnen zeer nuttig zijn bij het bepalen van de afstamming. Korte tandemherhalingen worden gebruikt voor bepaalde genealogische DNA-tests.
Bij genetische vingerafdrukken en DNA-profilering wordt het DNA onderzocht aan de hand van tandemherhalingen in het chromosomale DNA.
Referentie
1. ↑ Burt A. & Trivers R. 2006. Genen in conflict: de biologie van zelfzuchtige genetische elementen. Harvard University Press. "Tandemherhalingen" p364/6 & p582.
2. ↑ "Kopieën van basenpaarsequenties kunnen achter elkaar herhaald worden langs een chromosoom: bijvoorbeeld de 40S rRNA-genen in somatische cellen van padden, waarvan er ongeveer 500 kopieën zijn". Aangepast van Biology-Online.org [1]
3. ↑ Tandem herhaling in de US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH) [2].
4. ↑ Alberts, Bruce et al 2002. Moleculaire biologie van de cel. Garland, G31.
