Jules A. Hoffmann (geboren 2 augustus 1941) is een in Luxemburg geboren Franse bioloog. Hij is onderzoeksdirecteur en lid van de raad van beheer van het Nationaal Centrum voor Wetenschappelijk Onderzoek (CNRS) in Straatsburg, Frankrijk. In 2007 werd hij voorzitter van de Franse Academie van Wetenschappen.

Samen met Bruce Beutler ontving Hoffmann in 2011 de helft van de Nobelprijs voor fysiologie of geneeskunde voor "hun ontdekkingen betreffende de activering van aangeboren immuniteit". Hoffmann ontdekte de functie van het Toll-gen van de fruitvlieg in de aangeboren immuniteit. De homologen ervan bij zoogdieren, de toll-like receptoren, werden ontdekt door Beutler. Toll-like receptoren identificeren bestanddelen van andere organismen zoals schimmels en bacteriën, en brengen een immuunreactie op gang. Dit verklaart hoe septische shock kan worden teweeggebracht door bacteriële resten.