Het aangeboren immuunsysteem verdedigt de gastheer tegen infecties. Het omvat cellen die ziekteverwekkers (kiemen) meteen herkennen en erop reageren. De reactie van het aangeboren immuunsysteem is niet specifiek: het reageert op dezelfde manier op alle ziekteverwekkers die het herkent.

In tegenstelling tot het adaptieve immuunsysteem geeft het aangeboren immuunsysteem geen langdurige immuniteit tegen specifieke infecties.

Aangeboren immuunsystemen verdedigen zich snel tegen infecties bij alle planten en dieren. Het aangeboren systeem is de evolutionair oudere verdedigingsstrategie. Het is het belangrijkste immuunsysteem in planten, schimmels, insecten en primitieve meercellige organismen. Het systeem kan zich niet aanpassen en verandert niet in de loop van een mensenleven.

Het gewervelde aangeboren immuunsysteem: