Database van moleculaire bewegingen
De Database of Macromolecular Motions is een bioinformaticadatabase op internet. Het probeert de bewegingen van eiwit en sommige biologische RNA-moleculen in verschillende types in te delen.
Beschrijving
Het is oorspronkelijk gemaakt door Mark B. Gerstein, Werner G. Krebs en Nat Echols in de groep moleculaire biofysica en biochemie aan de universiteit van Yale. Mensen kunnen via een internetpagina in deze computerdatabank naar een bepaalde beweging zoeken aan de hand van de naam van het eiwit of het nummer van de Protein Data Bank. Veel mensen vinden deze computerdatabase echter door gewoon van de internetpagina voor de eiwitvermelding bij de Protein Data Bank te komen. Voor eiwitten die in beide computerdatabanken voorkomen, geeft deze andere computerdatabank vaak een link terug naar de internetpagina voor het eiwit op deze internetsite.
De computerdatabase bevat een internethulpmiddel of gratis Software as a Service (de "Morph-server") waarmee niet-experts bepaalde eiwitbewegingen kunnen zien door het genereren van korte filmbeelden. De films worden automatisch gemaakt door computersoftware op de internetsite. Na afloop stuurt de internetsite een e-mail met de bewegende beelden terug naar de gebruiker.
Het hulpmiddel "Morph Server" was oorspronkelijk eerder een onderzoeksinstrument dan een hulpmiddel voor het maken van bewegende beelden, en bood de gebruiker dus slechts beperkte controle over rendering, kleur en gezichtspunt, en de oorspronkelijke methode vergde soms behoorlijk wat computertijd om te voltooien. Sinds de eerste introductie van de site in 1996 is de website verbeterd om te proberen enkele van deze problemen op te lossen en nieuwe dingen toe te voegen. Andere mensen hebben nu alternatieve systemen gemaakt, zoals MovieMaker van de Universiteit van Alberta.
