Flagler County, in Florida, Verenigde Staten, werd opgericht in 1917. Het werd genoemd naar Henry Morrison Flagler, een beroemde spoorwegbouwer die de Florida East Coast Railway aanlegde.

In 1998, toen twee bosbranden in Flagler County dreigden uit te groeien tot één grote bosbrand, werd een verplichte evacuatie afgekondigd voor de hele county. Dit was de eerste en tot nu toe enige keer dat een hele county in Florida werd geëvacueerd. Flagler is ook een sportstad. Drie honkbalteams van Flagler hebben de afgelopen 2 jaar het staatstoernooi gehaald.