In ruil voor de Jedi, Luke naast Leia, Chewbacca, R2-D2, C-3PO en Lando Calrissian poging om Han Solo te redden van Jabba The Hutt, maar mislukken en uiteindelijk gevangen genomen en veroordeeld tot de Sarlacc Pit. Echter, Luke, met behulp van R2-D2's hulp, bedenkt een plan en is in staat om te ontsnappen aan de Pit en zijn vrienden te redden, het doden van Boba Fett en Jabba The Hutt in het proces.
Hierna keert Luke terug naar Dagobah om zijn training met Yoda af te sluiten, maar hij leert dat hij stervende is. In zijn stervende adem bevestigt Yoda dat Darth Vader/Anakin de vader van Luke is en vertelt de jonge held dat hij Vader opnieuw moet confronteren om zijn Jedi training af te ronden. Luke ontmoet dan de Force Ghost van Obi-Wan Kenobi, die ook Luke's afkomst bevestigt en stelt dat hij de waarheid heeft verteld, vanuit een bepaald oogpunt. Obi-Wan verzekert Luke dat hij Vader moet doden, maar Luke weigert, omdat hij gelooft dat hij zijn vader nog steeds kan redden. Hierna leert Luke dat Leia ook zijn zus is. Luke, Han en Leia gaan naar de maan van Endor om het Rijk voor eens en altijd tegen te houden in hun nieuw gebouwde Death Star II. Luke gaat over naar Vader, in een poging zijn vader te redden, die beweert dat Anakin Skywalker dood is en dat de Keizer binnenkort Luke's nieuwe meester zal zijn.
Bij het bereiken van de Troonzaal van de keizer leert Lucas dat zijn rebellenvrienden in de val lopen en proberen de keizer te doden, maar wordt tegengehouden door Vader. Vader en zoon duelleren opnieuw, waarbij Lukas de donkere kant gebruikt om Vader te overmeesteren. Als hij zich realiseert dat hij het ding wordt dat hij gezworen heeft te vernietigen, ontkent Lucas de wens van zijn vader om het gevecht voort te zetten, maar hij slaat boos op zijn vader af als deze dreigt Leia naar de Duistere Kant te sturen. Luke overmeestert en verslaat zijn vader op brute wijze, maar valt niet meer aan nadat hij door de keizer is uitgedaagd. Lukas gaat terug, en beweert triomfantelijk een Jedi te zijn zoals zijn vader voor hem. Geïrriteerd probeert de Keizer Luke te doden met zijn Force Lightning, maar wordt zelf gedood door Anakin die zichzelf heeft verlost.
Luke draagt het dodelijk gewonde lichaam van zijn vader naar een van de shuttles als de Death Star II op het punt staat vernietigd te worden door de rebellenalliantie. Lucas verwijdert de helm van Vader en vader en zoon delen nog een laatste moment voordat Anakin aan zijn verwondingen bezwijkt. Onwillig om het lichaam van zijn vader te laten rotten in de explosie, neemt Luke het mee. Terwijl de rebellen hun overwinning op Endor vieren, cremeert Luke het lichaam van zijn vader. Samen met zijn vrienden ziet Luke de Force Ghosts van Obi-Wan, Anakin en Yoda naar hem kijken.