Pterodactyloidea is de onderorde van kortstaartige pterosaurussen. Hun fossielenarchief begint in het midden Jura. Zij zijn uitgestorven in de K/T uitsterving aan het einde van het Krijt. Pterodactylus, Pteranodon en Quetzalcoatlus behoren tot deze onderorde.
In 2014 werden in China resten gevonden van de vroegste pterodactyloïde. Het wordt Kryptodrakon genoemd. Zijn minimumleeftijd was 162,7 miljoen jaar geleden (mya). Dit is ongeveer vijf miljoen jaar ouder dan alle eerder bekende bevestigde exemplaren.
Recent werk toont aan dat de groep aan het eind van het Krijt meer variëteit had dan eerder werd gedacht. In het begin van de jaren 2010 werden verscheidene nieuwe pterosaurus taxa ontdekt die dateren uit het late Krijt. Deze vondsten omvatten sommige pterosaurus soorten van kleine grootte.
Aan het einde van de Krijt periode vond de Krijt-Paleogeen uitsterving plaats, waardoor alle niet-aviaanse en de meeste vogel dinosaurussen, evenals vele andere dieren, uitstierven. De pterosaurussen schijnen in deze gebeurtenis te zijn uitgestorven.
