Zeekomkommers communiceren met elkaar door hormonale signalen door het water te sturen.
Een opmerkelijk kenmerk van deze dieren is het collageen dat hun lichaamswand vormt. Dit kan naar believen worden losgemaakt en strakgetrokken. Als het dier zich door een kleine spleet wil persen, kan het de collageenverbindingen losmaken, en zich in de ruimte storten. Om zich in deze spleten veilig te houden, haakt de zeekomkommer al zijn collageenvezels aan elkaar om zijn lichaam weer stevig te maken.
De dieren hebben een inwendige ademhalingsboom die in de inwendige waterige holte zweeft. Aan de achterzijde wordt water in en uit de cloaca gepompt, zodat gasuitwisseling plaatsvindt met de ademhalingsboom in de darm. p80
Defensie
Sommige soorten koraalrifzeekomkommers verdedigen zich door kleverige cuvierbuizen uit te stoten om potentiële roofdieren te verstrikken. Deze tubuli zitten vast aan de ademhalingsboom in de darm. Wanneer ze schrikken, kunnen deze komkommers de buisjes door een scheur in de wand van de cloaca naar buiten laten komen. In feite spuit dit kleverige draden over een roofdier. Na anderhalve week tot vijf weken, afhankelijk van de soort, groeien er weer nieuwe buisjes aan. Het vrijkomen van deze tubuli kan ook gepaard gaan met de afscheiding van een giftige chemische stof, holothurine genaamd, die soortgelijke eigenschappen heeft als zeep. Deze chemische stof kan elk dier in de omgeving doden en is een van de manieren waarop deze sedentaire dieren zich kunnen verdedigen. Andere komkommers, die dit hulpmiddel missen, kunnen hun darmwand splijten, en hun darm en ademhalingsboom uitspuwen. Zij regenereren deze later. Zoölogen die dit meemaken, geloven dat het een indrukwekkend afschrikmiddel is. "De puinhoop die één individu kan maken moet je zien om het te geloven". p81
Het bestaan van deze verdedigingswerken verklaart waarom de holothuriërs het zonder het sterke skelet van hun voorouders konden stellen.
Voederen
Sterk gemodificeerde buisvoetjes rond de mond zijn altijd aanwezig. Dit zijn vertakte en intrekbare tentakels, veel groter dan de gewone buisvoeten. Zeekomkommers hebben tussen de tien en dertig van dergelijke tentakels, afhankelijk van de soort. Rond de mond en de slokdarm bevindt zich een ring van grotere gehoorbeentjes, waaraan de spieren van de buisvoetjes zijn bevestigd. Met hun kleverige tentakels verzamelen de dieren detritus en kleine organismen.
