Het eiland Bohol heeft veel kleine heuvels. Er zijn twee bergketens die ongeveer parallel lopen aan het noordwesten en het zuidoosten. De belangrijkste bergketen van het eiland is de Sierra Bullones in het zuidoosten, langs de zuidkust. Het begint bij Loboc, loopt naar het oosten en vervolgens naar het noordoosten om te eindigen bij Candijay. Het hoogste punt van deze bergketen en van de hele provincie is de berg Mayana, 870 m hoog.
Een plateau in het binnenland van het eiland heeft veel kalkstenen heuvels. In Carmen, Batuan en Sagbayan vormen deze heuvels in grote aantallen bijna perfecte kegels en staan bekend als de Chocolate Hills.
Er zijn vele witte zandstranden langs de kust van het hoofdeiland en op andere eilanden van de provincie. De bekendste van deze stranden liggen op het eiland Panglao, en daar hebben talrijke eilandjes soortgelijke, maar ongerepte en mooie stranden.
Het eiland Panglao is relatief vlak met twee heuvels. Het eiland staat bekend om zijn prachtige stranden, en de bekendste daarvan is Alona Beach aan de zuidkant van het eiland.
Het eiland Lapinig ligt ten noordoosten van het eiland Bohol, voor de gemeente Pres. Carlos P. Garcia. Het eiland is vlak met heuvels in het midden tot een hoogte van 100 m.
Rivieren en watervallen
Er stromen vier grote rivieren door Bohol:
- Loboc stroomt van het midden van het eiland naar de zuidoostelijke kust.
- Inabanga, de grootste rivier van het eiland, stroomt in het noordwesten van de provincie.
- Abatan stroomt in het zuidwesten; en
- In het noorden stroomt de rivier de Ipil.
Talrijke watervallen en grotten liggen verspreid over het eiland, waaronder de prachtige Mag-Aso watervallen in Antequera.
Eilanden
De eilanden rond het vasteland van Bohol die deel uitmaken van de provincie Bohol zijn:
- Alicia
- Bagatusan
- Bagong Banwa
- Balicasag
- Banacon
- Banbanan
- Bansaan
- Batasan
- Baai Sa Owak
- Bilangbilangan
- Bonbon
- Bosaan
- Buabuahan
- Bugatusan
- Busalian
- Cabilao
- Cabul-an
- Cabantulan
- Cabgan
- Calangaman
- Cancoslino
- Calituban
- Cataban
- Catang
- Cati-il
- Cuaming
- Danajon
- Gak-ang
- Gaus
- Guindacpan
- Hambongan
- Hingutanan
- Inanoran
- Jaguliao
- Jandayan
- Jao
- Juagdan
- Lapinig
- Lapinin Chico
- Limasoc
- Lumislis
- Ma-agpit
- Mahanay
- Makaina
- Makalingao
- Malingin
- Mantatao Daku
- Mantatao Gamay
- Maomauan
- Maubay
- Mocaboc
- Nasingin
- Nocnocan
- Pamasaun
- Pamilacan
- Pandanon
- Pandao
- Pangangan
- Pangapasan
- Panglao
- Pinango
- Potohan
- Pungtud
- Saag
- Sagasa
- Sandingan
- Sentingnenay
- Silo
- Sinandigan
- Tabangdio
- Talibon
- Talimobo
- Tambo
- Tangtaang
- Kuifje
- Tumok