Cryptosporidium is een protozoaire parasiet die uitbraken van diarree veroorzaakt.
Een aantal soorten Cryptosporidium kan zoogdieren besmetten. De meest voorkomende soort die de mens infecteert is Cryptosporidium parvum. De diarree kan ernstig worden bij kinderen en bij mensen met een verzwakt immuunsysteem. Het wordt vaak aangetroffen bij HIV-patiënten die diarree hebben. Bij gezonde volwassenen is de infectie meestal van korte duur.
Het is moeilijk te identificeren in het laboratorium. De oöcyten kunnen onder een microscoop worden gezien, maar ze kunnen verward zijn. De meeste cryptosporidia zijn 3-6 μm groot, maar in sommige rapporten zijn grotere cellen beschreven. Nieuwe real-time monitoring kan Cryptosporidium beter opsporen dan de oudere spot- en batch-testmethoden.
Als Cryptosporidium in het water wordt vermoed, is de veiligste optie het water dat wordt gebruikt om te drinken te koken.