Protozoën zijn kleine (maar niet eenvoudige) organismen. Het zijn eencellige heterotrofe eukaryoten, die bacteriën en andere voedselbronnen eten.
Het is een oude term, en de ruimere term protist geniet tegenwoordig de algemene voorkeur. Toch wordt "protozoa" vaak voor het gemak gebruikt, vooral in het lager onderwijs. Het is een nogal handige containerbegrip, maar eigenlijk worden "protozoa" ingedeeld in een aantal verschillende fyla.
De term is problematisch omdat moderne biochemische en genetische technieken aantonen dat hij verschillende, zeer verschillende soorten cellen omvat. Ze worden alleen aangetroffen in vochtige of aquatische habitats. Veel protozoënsoorten zijn symbionten, sommige zijn parasieten, en sommige zijn roofdieren van bodembacteriën en algen. Er zijn ongeveer 30.000 soorten protozoën.

