Gelelektroforese is een techniek die wordt gebruikt om mengsels zoals DNA en eiwitten te scheiden. De scheiding is gebaseerd op hoe positief of hoe negatief geladen een molecuul is, en op zijn grootte. Gelelektroforese gebruikt een gel (zoals gelatine) en er wordt een elektrisch veld door de gel gestuurd.

Het woord elektroforese komt van -electro, omdat een elektrisch veld wordt gebruikt, en -phoresis, wat beweging betekent.