Tijdens de voorbereiding waren verschillende van de samenzweerders bezorgd over de veiligheid van medekatholieken die op de dag van de geplande explosie in het Parlement aanwezig zouden zijn. Op vrijdagavond 26 oktober ontving Lord Monteagle een anonieme brief in zijn huis in Hoxton.
Mijn Heer, uit liefde voor sommige van uw vrienden ben ik bezorgd over uw veiligheid. Daarom adviseer ik u, nu u uw leven geeft, een excuus te bedenken om uw aanwezigheid bij dit parlement te verzetten, want God en de mens zijn overeengekomen de goddeloosheid van deze tijd te straffen. want hoewel er geen schijn van enige beroering is, toch zeg ik dat ze een vreselijke klap zullen krijgen dit parlement en toch zullen ze niet zien wie hen pijn doet. Deze raad moet niet worden veroordeeld omdat het u goed kan doen en u geen kwaad kan doen want het gevaar is geweken zodra u de brief hebt verbrand en ik hoop dat God u de genade zal geven om er goed gebruik van te maken aan wiens heilige bescherming ik u beveel.
Monteagle liet het briefje hardop voorlezen, mogelijk om de samenzweerders te waarschuwen dat het geheim bekend was, en overhandigde het prompt aan Robert Cecil, 1e graaf van Salisbury, de minister van Buitenlandse Zaken. De samenzweerders hoorden de volgende dag van de brief, maar besloten door te gaan met hun plan, vooral nadat Fawkes de kelder had geïnspecteerd en constateerde dat er niets was aangeraakt.
Nadat hij de brief had gezien, gaf de koning Sir Thomas Knyvet opdracht de kelders onder het Parlement te doorzoeken, wat hij in de vroege uren van 5 november deed. Kort na middernacht werd Fawkes gevonden bij het verlaten van de kelder die de samenzweerders hadden gehuurd. Hij werd gearresteerd en gaf zijn naam op als John Johnson. Binnen werden de vaten met buskruit ontdekt, verborgen onder stapels brandhout en kolen. Tijdens de arrestatie ontkende Fawkes zijn bedoelingen niet, maar verklaarde hij dat het zijn doel was geweest de koning en het parlement te vernietigen. Niettemin hield Fawkes vast aan zijn valse identiteit en bleef hij volhouden dat hij alleen handelde. Later in de ochtend, voor de middag, werd hij opnieuw ondervraagd. Hij werd ondervraagd over de aard van zijn medeplichtigen, de betrokkenheid van Thomas Percy, welke brieven hij van overzee had ontvangen en of hij al dan niet met Hugh Owen had gesproken.
Een brief van de heer van de slaapkamer, Sir Edward Hoby, gaf details van iedereen die door de explosie zou zijn getroffen:
Op 5 november begonnen wij een Parlement, waar de Koning in eigen persoon naar toe had moeten komen, maar zich onthield door een complot dat pas die morgen werd ontdekt. Het complot was om de Koning op te blazen op het moment dat hij op zijn koninklijke troon zat, de Adel en het Lagerhuis en met alle Bisschoppen, Rechters en Artsen op één moment, en de ontploffing om het hele landgoed en koninkrijk van Engeland te ruïneren.
Fawkes werd naar de Tower of London gebracht en daar gemarteld. Foltering was verboden, behalve op uitdrukkelijk bevel van de vorst of een orgaan zoals de Privy Council of de Star Chamber. In een brief van 6 november verklaarde Koning James I:
De zachtere folteringen moeten eerst tot hem worden gebruikt, et sic per gradus ad maiora tenditur [en zo met stappen uitgebreid tot grotere], en zo bespoedigt God uw goede werk.
Het volk was blij dat de koning en zijn zonen het Gunpowder Plot hadden overleefd. Het volgende parlement had gevoelens van loyaliteit en goodwill, die Salisbury gebruikte om hogere subsidies voor de koning te krijgen dan die welke tijdens Elizabeths bewind werden toegekend. In zijn toespraak tot beide Huizen op 9 november sprak James over twee belangrijke onderwerpen: het goddelijke recht van koningen en de katholieke kwestie. Hij benadrukte dat het complot het werk was geweest van slechts enkele katholieken, niet van de Engelse katholieken als geheel, en hij herinnerde de vergadering eraan zich te verheugen over zijn overleving, aangezien koningen goddelijk waren aangesteld en hij zijn ontsnapping te danken had aan een wonder.