Seksueel conflict is een term in de evolutionaire biologie. Het ontstaat in een soort wanneer de voordelen voor de vrouwtjes verschillen van die voor de mannetjes.
Het woord "voordeel" betekent hier "wat de voortplanting van de genen van de vrouw (of de man) ten goede komt". Het wordt uitgedrukt als een verschil in biologische geschiktheid.
Het conflict kan leiden tot een evolutionaire wapenwedloop tussen mannetjes en vrouwtjes. Het is voornamelijk bestudeerd bij dieren, hoewel het in principe van toepassing kan zijn op elk zich seksueel voortplantend organisme, zoals planten en schimmels.

