In de chemie is een geconjugeerd systeem een systeem van verbonden p-orbitalen met gedelokaliseerde elektronen. Geconjugeerde systemen worden gecreëerd door meerdere bindingen, elk gescheiden door enkele bindingen. In het algemeen kunnen geconjugeerde systemen de totale energie van het molecuul verlagen en de stabiliteit ervan verhogen. Ze kunnen losse paren, radicalen of carbenium-ionen bevatten. De verbinding kan cyclisch, acyclisch, lineair of gemengd zijn. In de meeste gevallen worden de atomen in een molecuul bij elkaar gehouden door enkele bindingen (waarbij de banen van aangrenzende atomen elkaar overlappen). Moleculen die een geconjugeerd systeem hebben, hebben unieke eigenschappen die verschillen van normale verbindingen die ontstaan door het delen van de gedelokaliseerde elektronen onder vele atomen.
Conjugatie is de overlapping van de ene p-orbitaal met de andere over een sigma-band (of enkele band) die ertussen ligt. (De d-orbitalen van grotere atomen kunnen ook bijdragen aan een geconjugeerd systeem).
Een geconjugeerd systeem heeft een gebied van overlappende p-orbitalen, waardoor de enkele bindingen die ertussen liggen, worden overbrugd. Ze maken een delokalisatie van pi elektronen over alle aangrenzende uitgelijnde p-orbitalen mogelijk. De pi elektronen behoren niet tot een enkele binding of atoom, maar tot een groep van atomen.
De grootste geconjugeerde systemen (met het grootste aantal gedeelde elektronen) zijn in grafiet, geleidende polymeren en koolstofnanobuizen.
