Hermafrodiet is een term die afkomstig is van Hermaphroditus, de zoon van Hermes en Aphrodite. Het wordt gebruikt als een wetenschappelijke term in de biologie.
In de zoölogie is een dier dat zowel sperma als eicellen kan produceren een hermafrodiet. De meeste regenwormen zijn bijvoorbeeld hermafrodieten. Een hermafrodiet heeft gedurende het hele leven beide geslachtsorganen. Een sequentiële hermafrodiet heeft eerst eierstokken, later vervangen door een testikel, of andersom.
In de plantkunde wordt hermafrodiet gebruikt voor 'complete' bloemen met zowel mannelijke als vrouwelijke delen, en voor planten met biseksuele voortplantingseenheden. Zie bloeiende plant sexualiteit voor details.
Bij mensen is de term hermafrodiet niet correct, omdat echt functionerende hermafrodieten bij de mens niet mogelijk zijn. Wat er soms gebeurt is een fout in de ontwikkeling die leidt tot interseksuele personen. Een definitie van interseks is :
"... individuen van een biseksuele soort die kenmerken hebben die tussen het mannetje en het vrouwtje in liggen."
Mensen die interseksueel zijn kunnen een zeer kleine penis hebben en geen testikels, of een zeer kleine en korte vagina en een grote clitoris die op een penis lijkt.