Histonen zijn eiwitten die worden aangetroffen in eukaryote celkernen, die het DNA verpakken in structurele eenheden die nucleosomen worden genoemd. Zij zijn de voornaamste eiwitbestanddelen van chromatine, het actieve bestanddeel van chromosomen.

Histonen fungeren als spoelen waar het DNA omheen wikkelt, en spelen een rol bij de genregulatie. Zonder histonen zou het afgewikkelde DNA in chromosomen erg lang zijn. Elke menselijke cel heeft bijvoorbeeld ongeveer 1,8 meter DNA, maar omwonden door de histonen heeft hij ongeveer 90 millimeter chromatine, die, wanneer ze tijdens de mitose worden gedupliceerd en gecondenseerd, resulteren in ongeveer 120 micrometer chromosomen.