Histologie is de studie van de microscopische anatomie van cellen en weefsels van planten en dieren. Het is een onderdeel van de cytologie, en een essentieel instrument van de biologie en de geneeskunde.

Histologie wordt meestal gedaan door cellen en weefsels te bekijken onder een lichtmicroscoop of elektronenmicroscoop. Het weefsel moet vooraf speciaal worden geprepareerd.