Pseudosuchians verschenen in het late Onderste Trias. Tegen het late Midden-Trias waren zij de dominante land carnivoren. Hun grote tijd was het Bovenste Trias, gedurende welke hun gelederen een aantal groepen carnivoren omvatten, en één groep herbivoren.
Het einde van het Trias veroorzaakte het uitsterven van de meeste pseudo-krokodillen. De voorouders van de hedendaagse krokodillen overleefden. Een in 2010 gepubliceerde studie suggereert dat vulkaanuitbarstingen het klimaat veranderden en een massa-uitsterving veroorzaakten die de belangrijkste concurrenten van de dinosauriërs uitroeide. Daardoor konden de dinosauriërs hen opvolgen als de dominante terrestrische vleeseters en planteneters.
Naarmate het Mesozoïcum vorderde, ontwikkelden zich meer typisch krokodilachtige vormen. Dinosauriërs waren de dominante dieren op het land, maar de proto-krokodillen floreerden in rivieren, moerassen en de oceanen. Deze vroege krokodillen kenden veel meer diversiteit dan tegenwoordig. Met het uitsterven van het Krijt stierven de dinosauriërs uit, behalve de vogels, terwijl de krokodillen met weinig verandering verder gingen. Vandaag zijn de krokodillen, alligators en gharials de overlevende vertegenwoordigers van dit geslacht.