In de driehoek bevindt zich het laagste punt van Afrika, het Asal-meer in Djibouti, op 155 m onder de zeespiegel.
De Awash rivier is de belangrijkste waterstroom in de regio. Hij staat droog tijdens het jaarlijkse droge seizoen, en eindigt als een keten van zoute meren. Het noordelijke deel van de Afar Depressie staat ook bekend als de Danakil Depressie. De laaglanden hebben te lijden onder hitte, droogte en een slechte luchtcirculatie. Sommige van de laaglanden zijn de heetste plaatsen (gemiddelde temperaturen het hele jaar door) van overal op aarde.
De Afar-driehoek wordt begrensd door hooggelegen gebieden, zoals te zien is op de topografische kaart.
Plaattektoniek
De depressie is een drievoudig tektonisch platenknooppunt. Dit geologisch kenmerk is een van de grote actieve vulkanische gebieden van de aarde, zodat de bodem van de depressie bestaat uit lava, meestal basalt.
Het continue proces van vulkanisme zorgt voor minerale afzettingen, zoals zwavel, zout, bentoniet en gips. Er zijn ook geothermische energiebronnen en warmwaterbronnen in verschillende gebieden van de regio.
In 2005 werd in slechts enkele dagen een reusachtige kloof gevormd. De kloof ontstond toen de Dabbahu vulkaan uitbarstte. De scheur maakt deel uit van het proces waarbij de Arabische en Afrikaanse platen uit elkaar bewegen. Deze nieuwe scheur, 500 meter lang en 60 meter diep, is ontstaan toen de lava van de uitbarstende vulkaan ondergronds stroomde en afkoelde. Binnen enkele dagen ontstond een 60 kilometer lange en 8 meter brede dijk.