Moleculaire chaperonnes zijn eiwitten die grote moleculen helpen vouwen of ontvouwen. Sommige helpen andere macromoleculaire structuren in elkaar te zetten of uit elkaar te halen. Zij komen in deze structuren niet voor wanneer de structuren hun normale functies uitoefenen.
Het eerste eiwit dat een chaperon wordt genoemd, helpt bij de assemblage van nucleosomen uit gevouwen histonen en DNA. Deze assemblage chaperonnes, vooral in de kern, assembleren gevouwen subeenheden tot grotere structuren zoals celorganellen.
Een belangrijke functie van chaperones is te voorkomen dat polypeptideketens en geassembleerde subeenheden samenklonteren tot klonters die niet functioneren. Sommige chaperones zijn "holdases" die aggregatie tegenhouden. Andere, "foldases" genoemd, helpen bij het vouwen van eiwitten die dat zelf niet kunnen. Dergelijke eiwitten zijn in strijd met Anfinsen's dogma.

