De bron van de Dajabón ligt bij de berg
Pico de Gallo, aan de noordkant van de Cordillera Central. Zij stroomt door de provincie
Dajabón en maakt vervolgens deel uit van de grens tussen
Haïti en de
Dominicaanse Republiek. Haar monding is in de baai van Manzanillo, aan de Atlantische Oceaan.
De afvoer (hoeveelheid water die per tijdseenheid door een deel van de rivier stroomt) bedraagt 2,84 kubieke meter per seconde in Don Miguel, een plaats enkele kilometers ten zuiden van de stad Dajabón.
De stad Dajabón is de belangrijkste Dominicaanse stad in de buurt van de rivier. De rivier stroomt ook door de stad Loma de Cabrera. Ook de Haïtiaanse stad Ouanaminthe ligt dicht bij de rivier.
De belangrijkste zijrivier is de rivier Capotillo (in Haïti, rivier Bernard). Er is geen belangrijke zijrivier in het lager gelegen deel.
De rivier Capotillo maakt deel uit van de noordgrens tussen Haïti en de Dominicaanse Republiek totdat zij samenvloeit met de rivier Dajabón tussen de steden Loma de Cabrera en Dajabón. Daarna volgt de grens de loop van de rivier Dajabón.